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“尽管人们在100多年前就发现了肿瘤中的细菌，但真正系统而深入的研究还不到10年，这是一个非常新的领域。”中国科学院昆明动物研究所(以下简称昆明动物研究所)研究员马占山，医学生态学系主任，人体微生物区系研究项目首席科学家。他认为早期微生物组研究技术、肿瘤动物模型技术、人体样本采集技术、数据分析技术等还不够成熟，限制了肿瘤菌群的研究。

马占山介绍，目前研究癌症菌群主要有两种方法，一种是利用荧光标记跟踪特定微生物种类，另一种是利用16S rRNA测序技术对细菌进行系统分类。最常用的分子钟。这些技术在100年前是不可用的。除此之外，最重要的是创意创新是不够的。医学生态学是医学微生物学、计算生物学、理论生态学和医学研究的交叉学科。2010年在昆明动物研究所成立的“计算生物学与医学生态学”课题组，是全球首个以新医学生态学研究理念为重点的实验室。致力于构建人类植物群的“医学生态学”理论框架。

昆明动物研究所癌症生物学小组组长陈ceshi研究员也认为，已知某些细菌和病毒会促进癌症。例如，幽门螺杆菌被认为是胃癌的罪魁祸首之一。梭杆菌促进结直肠癌的发生和发展。然而，许多实体瘤只有少量的细菌，而且各种细菌的异质性很大。厌氧条件下生长缓慢，难以培养，难以确定取样污染是否引起的，也是研究的重要原因。

魏茨曼科学研究所的科学家们用聚合酶链反应放大16 s rRNA,免疫组织化学检测细菌表面组件,免疫荧光杂交检测16 s rRNA,和细菌体外文化、代谢标记等方法,发现大多数肿瘤,特别是在乳腺癌细胞内的细菌和免疫细胞。这些细菌与肿瘤类型、患者是否吸烟以及对免疫治疗的反应有关。